不同16S rDNA靶序列對DGGE分析活性污泥群落的影響

不同16S rDNA靶序列對DGGE分析活性污泥群落的影響

摘要： 為探討不同通用引物擴增16S rDNA靶序列對活性污泥微生物群落分析的影響,更合理的利用變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術(shù)分析活性污泥樣品.從連續(xù)流攪拌槽式反應(yīng)器(CSTR)中獲取活性污泥,以3對通用引物341f/534r、968f/1 401r和341f/926r擴增16S rDNA序列,用DGGE分離PCR擴增產(chǎn)物.研究表明采用不同引物對進行DGGE分析時,群落多樣性和動態(tài)存在顯著的差異.341f/534r和968f/1 401r的靶序列分離效果較好,341f/926r的靶序列分離效果較差.引物341f/534r和341f/926r DGGE圖譜顯示S2和S3相似性高,引物968f/1 401r DGGE圖譜顯示S1和S2相似性高.由此可見采用不同引物對進行DGGE分析時,群落結(jié)構(gòu)之間的相似性和動態(tài)是不一致的.341f/534r的DGGE圖譜中條帶豐富,多樣性最好,968f/1 401r的DGGE圖譜次之,341f/926r DGGE圖譜條帶最少,多樣性也較差.因此,在利用DGGE分析活性污泥樣品時采用引物341f/534r和968f/1 401r是比較適宜的. 作 者： 邢德峰    任南琪    宋佳秀    曲敏    徐香玲    XING De-feng    REN Nan-qi    SONG Jia-xiu    QU Min    XU Xiang-ling   作者單位： 邢德峰,任南琪,宋佳秀,XING De-feng,REN Nan-qi,SONG Jia-xiu(哈爾濱工業(yè)大學市政環(huán)境工程學院,哈爾濱,150090)

曲敏,QU Min(哈爾濱師范大學生命與環(huán)境科學學院,哈爾濱,150080;哈爾濱商業(yè)大學食品工程學院,哈爾濱,150076)

徐香玲,XU Xiang-ling(哈爾濱師范大學生命與環(huán)境科學學院,哈爾濱,150080) 

期 刊： 環(huán)境科學  ISTICPKU   Journal： CHINESE JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCE  年，卷(期)： 2006, 27(7)  分類號： X172  關(guān)鍵詞： DGGE    16S rDNA    活性污泥    群落動態(tài)    群落多樣性   

【不同16S rDNA靶序列對DGGE分析活性污泥群落的影響】相關(guān)文章：

不同會議現(xiàn)場的座次分析11-30

革蘭氏染色結(jié)果的影響因素及原因分析10-10

“靶課”探尋新課程教學的好途徑04-28

序列號是什么知識07-19

小學作文序列訓(xùn)練開題報告04-27

生物群落的演替教學教案08-26

環(huán)境影響評價師對開發(fā)區(qū)規(guī)劃方案分析04-27

不同的態(tài)度 不同的結(jié)果教學反思04-28

不同的作文11-12

不同優(yōu)秀作文03-02