植物翻譯控制腫瘤蛋白的分子結(jié)構(gòu)特征與功能預(yù)測分析

植物翻譯控制腫瘤蛋白的分子結(jié)構(gòu)特征與功能預(yù)測分析

翻譯控制腫瘤蛋白(The translationally controlled tumor protein,TCTP)是一類廣泛存在于動物、植物及酵母中的,在進(jìn)化上高度保守、與其它任何蛋白家族均未顯示出明顯的序列同源性的蛋白.采用生物信息學(xué)的方法和工具對已在GenBank上注冊的擬南芥(Arabidopsis thaliana)、牽牛(Ipomoea nil)、草莓(Fragaria x ananassa)、橡膠樹(Heveabrasiliensis)、南瓜(Cucurbita maxima)、卷心菜(Brassica oleracea)的翻譯控制腫瘤蛋白的核苷酸及氨基酸序列進(jìn)行分析,并對其組成成分、轉(zhuǎn)運(yùn)肽、跨膜結(jié)構(gòu)域、疏水性/親水性、蛋白質(zhì)的二級及三級結(jié)構(gòu)、分子系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系等進(jìn)行預(yù)測和分析.結(jié)果 表明,該基因的全長包括5'、3'非翻譯區(qū)和一個(gè)開放讀碼框,其編碼的蛋白是一個(gè)無跨膜結(jié)構(gòu)域,不具轉(zhuǎn)運(yùn)肽的親水性蛋白,包括一個(gè)β-折疊核心區(qū)和一個(gè)主要的α-螺旋區(qū),不規(guī)則卷曲散布于整個(gè)蛋白質(zhì)中,具有TCTP-1和TCTP-2兩個(gè)特征結(jié)構(gòu)域.

作 者： 陳玉芹 王喆之 Chen Yuqin Wang Zhezhi   作者單位： 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,西安,710062  刊 名： 生物技術(shù)通報(bào)  PKU 英文刊名： BIOTECHNOLOGY BULLETIN  年，卷(期)： 2008 ""(2)  分類號： Q94  關(guān)鍵詞： 翻譯控制腫瘤蛋白(TCTP)   分子結(jié)構(gòu)   功能預(yù)測   生物信息學(xué)  

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