蛋白質(zhì)序列中的關(guān)聯(lián)規(guī)則發(fā)現(xiàn)及其應(yīng)用

時(shí)間:2023-04-27 14:34:05 生物醫(yī)學(xué)論文 我要投稿
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蛋白質(zhì)序列中的關(guān)聯(lián)規(guī)則發(fā)現(xiàn)及其應(yīng)用

隨著蛋白質(zhì)序列-結(jié)構(gòu)分析中使用的機(jī)器學(xué)習(xí)算法越來越復(fù)雜,其結(jié)果的解釋和發(fā)現(xiàn)過程也隨之復(fù)雜化,因此有必要尋找簡單且理論上可靠的方法.通過引入原理簡單、理論可靠、結(jié)果具有很強(qiáng)實(shí)際意義的關(guān)聯(lián)規(guī)則發(fā)現(xiàn)算法,找到了蛋白質(zhì)序列中數(shù)以萬計(jì)的模式.結(jié)合實(shí)例演示了如何將這些模式應(yīng)用于蛋白質(zhì)序列分析中,如保守區(qū)域發(fā)現(xiàn)、二級結(jié)構(gòu)預(yù)測等.同時(shí)根據(jù)這些結(jié)果構(gòu)建了一個(gè)二級結(jié)構(gòu)規(guī)則庫和一種簡單的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測算法,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,約81%的二級結(jié)構(gòu)可以由至少一條關(guān)聯(lián)規(guī)則預(yù)測得到.

作 者:   作者單位:   刊 名: 生物物理學(xué)報(bào)  ISTIC PKU 英文刊名: ACTA BIOPHYSICA SINICA  年,卷(期): 2006 22(3)  分類號: Q5  關(guān)鍵詞: 蛋白質(zhì)序列   關(guān)聯(lián)規(guī)則   二級結(jié)構(gòu)預(yù)測   模式發(fā)現(xiàn)  

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