基于近似熵的偽氨基酸組成預測蛋白質(zhì)亞核定位

時間:2023-04-26 20:50:19 數(shù)理化學論文 我要投稿
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基于近似熵的偽氨基酸組成預測蛋白質(zhì)亞核定位

了解真核細胞中細胞核內(nèi)蛋白質(zhì)的定位情況對于新發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)的功能注釋具有重要意義.隨著蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中蛋白質(zhì)序列數(shù)量的急速增加,采用計算方法來預測蛋白質(zhì)亞核定位已經(jīng)成為蛋白質(zhì)科學領域研究的熱點.根據(jù)Chou提出的偽氨基酸組成離散模型,提出了一種新的蛋白質(zhì)亞核定位預測方法.計算蛋白質(zhì)序列的近似熵作為附加特征構建偽氨基酸組成,表示蛋白質(zhì)序列特征,AdaBoost分類算法作為預測工具.與已報道的亞核定位預測方法的性能相比,這種方法具有更高的準確率.

作 者: 張同亮 丁永生 顧全 孫登寬 ZHANG Tong-liang DING Yong-sheng GU Quan SUN Deng-kuan   作者單位: 張同亮,顧全,孫登寬,ZHANG Tong-liang,GU Quan,SUN Deng-kuan(東華大學信息科學與技術學院,上海,201620)

丁永生,DING Yong-sheng(東華大學信息科學與技術學院,上海,201620;數(shù)字化紡織服裝技術教育部工程研究中心,上海,201620) 

刊 名: 生物物理學報  ISTIC PKU 英文刊名: ACTA BIOPHYSICA SINICA  年,卷(期): 2008 24(3)  分類號: O61  關鍵詞: 蛋白質(zhì)亞核定位   偽氨基酸組成   近似熵   AclaBoost分類器  

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