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哺乳動物MHC密碼子使用概率的聚類分析
利用系統(tǒng)聚類分析方法對隨機選取的3種哺乳動物的60個主要組織相容性復(fù)合體(MHCⅠ類和Ⅱ類)基因的mRNA序列進行了同義密碼子使用概率偏性研究.結(jié)果發(fā)現(xiàn),不同物種的MHC基因群中類型相同的基因具有相近的同義密碼子使用偏性,而對于同一類型的基因由物種引起的同義密碼子使用偏性的差異較小.即功能和類型決定密碼子使用模式的大的分類,而物種決定該大類中進一步的差異.基因密碼子偏向性的研究對于大幅度增加目標(biāo)蛋白的產(chǎn)量具有重要的意義.該結(jié)果也為基因分類和基因功能的預(yù)測提供了新的生物信息學(xué)方法.
作 者： 周童 馬建民 顧萬君 孫嘯 陸祖宏 作者單位： 東南大學(xué)吳健雄實驗室, 南京 210096 刊 名： 東南大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版) ISTIC EI PKU 英文刊名： JOURNAL OF SOUTHEAST UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION) 年，卷(期)： 2001 31(2) 分類號： Q52 關(guān)鍵詞： 同義密碼子 密碼子偏性 MHC 聚類分析 生物信息學(xué)【哺乳動物MHC密碼子使用概率的聚類分析】相關(guān)文章：
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