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采用粒子群優(yōu)化的基因轉(zhuǎn)錄差異分析模型
高通測序技術(shù)可以更加全面地檢測實(shí)驗(yàn)樣本中基因轉(zhuǎn)錄水平,這使得對樣本間基因轉(zhuǎn)錄差異的分析精度越來越準(zhǔn)確.根據(jù)通過DNA高通測序技術(shù)獲得的基因轉(zhuǎn)錄區(qū)內(nèi)Pol Ⅱ蛋白個(gè)數(shù),提出了兩個(gè)樣本間基因轉(zhuǎn)錄差異分析模型.該模型在考慮同一基因間轉(zhuǎn)錄差異的同時(shí),引入了全基因的轉(zhuǎn)錄分布特性以提高模型分析精度.模型采用預(yù)測概率最大化統(tǒng)計(jì)算法進(jìn)行參數(shù)求取.在概率最大化步驟中,由于難以得到模型參數(shù)解析解和提高算法效率,采用粒子群優(yōu)化算法直接進(jìn)行求取模型參數(shù)數(shù)值解.乳腺癌實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)測試表明,該模型可有效分析不同樣本間基因轉(zhuǎn)錄差異.
作 者： 馮偉興 王科俊 作者單位： 哈爾濱工程大學(xué)模式識別與智能系統(tǒng)研究所,哈爾濱,150001 刊 名： 中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)報(bào) ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF BIOMEDICAL ENGINEERING 年，卷(期)： 2010 29(2) 分類號： Q332 關(guān)鍵詞： 基因 轉(zhuǎn)錄差異 粒子群 分析模型【采用粒子群優(yōu)化的基因轉(zhuǎn)錄差異分析模型】相關(guān)文章：
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