- 相關(guān)推薦
哺乳動(dòng)物驅(qū)動(dòng)蛋白的計(jì)算基因組學(xué)分析與鑒定
提供了一種新穎的、基于比較基因組學(xué)方法的全長(zhǎng)驅(qū)動(dòng)蛋白預(yù)測(cè)方法(full-length kinesin prediction program,FKPP),用于哺乳動(dòng)物中驅(qū)動(dòng)蛋白質(zhì)組的鑒定與研究.之前的預(yù)測(cè)認(rèn)為,哺乳動(dòng)物共含94個(gè)驅(qū)動(dòng)蛋白,而用FKPP從哺乳動(dòng)物的基因組中總共鑒定出134個(gè)可能的驅(qū)動(dòng)蛋白基因.基于數(shù)據(jù)庫(kù)中存在的片段序列,用FKPP鑒定出25個(gè)可能的全長(zhǎng)驅(qū)動(dòng)蛋白.此外,用FKPP方法發(fā)現(xiàn)人的動(dòng)點(diǎn)馬達(dá)蛋白CENP-E應(yīng)包含2701個(gè)氨基酸,而不是當(dāng)初根據(jù)克隆預(yù)測(cè)的2663個(gè)氨基酸.通過對(duì)CENP-E的cDNA進(jìn)行重測(cè)序,并同時(shí)采用特異性識(shí)別FKPP預(yù)測(cè)的CENP-E多肽抗體予以實(shí)驗(yàn)評(píng)估,結(jié)果表明,FKPP預(yù)測(cè)的CENP-E氨基酸序列是正確的.為此,本研究利用FKPP對(duì)哺乳動(dòng)物的驅(qū)動(dòng)蛋白進(jìn)行了重新分類.鑒于目前公共數(shù)據(jù)庫(kù)含有較多非全長(zhǎng)序列的蛋白片段,FKPP可提供一個(gè)具有顯著效率且準(zhǔn)確新穎的全長(zhǎng)序列預(yù)測(cè)手段,用于驅(qū)動(dòng)蛋白以及其他蛋白家族的分子鑒定.
作 者： 薛宇 劉丹 符傳孩 竇震 周慶 姚雪彪 作者單位： 薛宇,劉丹,符傳孩,竇震,姚雪彪(中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)細(xì)胞動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)室及合肥微尺度物質(zhì)科學(xué)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室,合肥,230027)周慶(中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)細(xì)胞動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)室及合肥微尺度物質(zhì)科學(xué)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室,合肥,230027;浙江大學(xué)農(nóng)學(xué)院,杭州,310003)
刊 名： 科學(xué)通報(bào) ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE SCIENCE BULLETIN 年，卷(期)： 2006 51(14) 分類號(hào)： Q95 關(guān)鍵詞： 驅(qū)動(dòng)蛋白 比較基因組學(xué) CENP-E 全長(zhǎng)驅(qū)動(dòng)蛋白預(yù)測(cè)方法(FKPP)【哺乳動(dòng)物驅(qū)動(dòng)蛋白的計(jì)算基因組學(xué)分析與鑒定】相關(guān)文章：
成本計(jì)算與分析實(shí)訓(xùn)報(bào)告10-21
蛋白質(zhì)04-07
形狀記憶合金驅(qū)動(dòng)薄壁圓管扭轉(zhuǎn)變形分析及試驗(yàn)研究論文（精選6篇）12-22
蛋白提取實(shí)驗(yàn)步驟03-21
蛋白質(zhì)的教案及反思04-25
計(jì)算機(jī)專業(yè)實(shí)習(xí)鑒定11-30
領(lǐng)域驅(qū)動(dòng)設(shè)計(jì)之體會(huì)二04-25
高三創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)型作文05-08
高蛋白食物有哪些03-03